《博物馆奇妙夜3电影》某城中村因强行征地拆迁发生群体性械斗村民常青因在械斗中失手打死强拆人员而被公安机关提请逮捕村民对此十分不满同时反映官商勾结要求严肃查处从中非法获利的腐败官员市检察院侦查监督处女检察官张芸在审查常青故意伤害案中发现报捕的材料矛盾重重遂与负责查处城中村事件背后渎职犯罪的反渎局局长顾长风相互配合从犯罪嫌疑人马义成在一起人为的交通事故中死亡入手顺藤摸瓜陆续查出强拆公司头目杨胜强、“金玉华庭”老板金玉庭等人与土地规划、房产管理等部门官员相互勾结非法出让、倒卖土地违规办理“两证”等犯罪事实为逃避法律追究金玉庭等人对顾长风或以金钱收买或以绑架其年幼的女儿相威胁顾毫不退缩并得到对他爱慕已久的张芸的无私帮助慧瑛在某次缉拿要犯时因其个人英雄主义仲其拍挡当场殉职上司对她极为不满又一次她与国强奉命押送嫌犯黑皮途中一时疏忽让他逃脱慧瑛对此深感内疚誓言要亲手缉拿点及行动中慧瑛不慎受伤在同僚国强与世华日以继夜追查下得知黑皮将与黑社会老大冯子祥谈判于是国强暗中监视静待时机逮捕他们及后双方发生激战黑皮欲逃走但在慧瑛穷追不舍下走投无路只好弃械投降……重案组肥棠(林雪 饰)嗜赌成性欠下高利贷终日被放债人陈耀雄(林家栋 饰)追讨肥棠被逼无奈竟打起警署内赃款的主意他盗取赃款却仍填不上债务窟窿只好藏进小旅馆躲避阿雄PTU的沙展阿森(任达华 饰)得知肥棠私盗赃款想方设法保护和帮助好友却毕竟能力有限 偶然机会肥棠和隔壁四个潮州同乡相识更因其专业车手的经历和技术得到对方赏识不曾想这四人竟是内地过来的悍匪他们力邀肥棠入伙为金钱和道义所惑的肥棠踟蹰不定迷途的警察能否找到归来的路...